Ptolemaeus VI Philometor (ong. 191 v. Chr.-145 v. Chr.) was koning van Egypte van 180 v. Chr.-145 v. Chr. Hij was een jaar of twaalf toen hij zijn vader Ptolemaeus V Epiphanes opvolgde en regeerde gezamenlijk met zijn moeder Cleopatra I tot zij stierf in 176 v. Chr.
Het jaar daarna trouwde hij met zijn zuster Cleopatra II
In 170 v. Chr. begon Antiochus IV de zesde Syrische oorlog en viel tweemaal Egypte binnen.
Hij werd zelfs als koning van Egypte gekroond maar de senaat van Rome dwong hem de titel weer op te geven. Daarna werd van 169-164 v. Chr. het land gezamenlijk geregeerd door Ptolemaeus VI, zijn zuster eega Cleopatra en een jongere broer Ptolemaeus VIII.
Ptolemaeus VI werd in 164 v. Chr. door zijn jongere broer van de troon gestoten en ging naar Rome waar hij de steun van Cato verwierf. Hij werd daardoor weer op de troon hersteld maar de Alexandrijnen kwamen in opstand tegen hem.
Hij sloeg de rebellie wreed neer, maar werd zelf in Syrië in de strijd tegen Alexander Balas gedood.